20. 6. 2019  2:51 Valéria
Akademický informační systém

Přehled vypsaných témat - Fakulta chemickej a potravinárskej technológie


Základní údaje

Typ práce: Disertační práce
Název tématu: Pomocné xylánolytické enzýmy
Název tématu anglicky: Auxiliary xylanolytic enzymes
Stav tématu: schváleno (prof. Ing. Albert Breier, DrSc. - Předseda oborové rady)
Vedoucí práce: Mgr. Vladimír Puchart, PhD.
Fakulta: Fakulta chemickej a potravinárskej technológie
Garantující pracoviště: Ústav biochémie a mikrobiológie (FCHPT)
Max. počet studentů: --
Akademický rok:2019/2020
Navrhl: Mgr. Vladimír Puchart, PhD.
Externí vzdělávací instituce: Chemický ústav Slovenskej akadémie vied
Anotace: Xylán je hlavnou hemicelulózou tvrdých drevín. Je významne zastúpený aj v mäkkých drevinách. Okrem toho je jedným zo zásobných polysacharidov v semenách obilnín. Je to pentózan zložený z beta-1,4-viazaných xylopyranozylových jednotiek, ktoré sú do rôzneho stupňa ovešané rozličnými postrannými reťazcami. Dobre pochopený je vplyv týchto vetiev na endoxylanázy, hlavné enzýmy rozkladajúce tento polysacharid. Je však nedostatok informácií o vplyve týchto vetiev na pôsobenie takzvaných pomocných xylánolytických enzýmov, predovšetkým o vplyve iných substituentov v blízkosti väzby, ktorá sa má enzýmami štiepiť. Skúmanie týchto vplyvov bude témou doktorandského štúdia. Konkrétne sa bude študovať vplyv rôznych kombinácií substitúcií kyselinou octovou, kyselinou (4-O-metyl-)alfa-D-glukurónovou a alfa-L-arabinofuranózou na tom istom alebo susednom xylopyranozylovom zvyšku. Komerčne dostupné, v laboratóriu pripravené i chemicky nasyntetizované oligosacharidy sa použijú ako substráty na rozlíšenie rôznych typov acetylxylán¬esteráz, alfa-glukuronidáz a beta-xylozidáz. Všetky tieto enzýmy sú na základe aminokyselinových sekvencií zoskupené do rôznych rodín sacharidových esteráz a glykozidhydroláz, avšak táto klasifikácia doteraz nie je daná do súvislosti s rozpoznávaním alebo tolerovaním substrátov, ktoré sú vetvené komplikovanejším spôsobom. Tieto komplikovanejšie štruktúry sa pokladajú sa prirodzené substráty pre vyššie uvedené a doteraz podceňované enzýmy, ktoré sú však rovnako dôležité pre ekonomicky uskutočniteľné zužitkovanie rastlinnej hmoty.
Anotace anglicky: Xylan is a principal hemicellulose of hardwoods. It is also abundant in softwoods. Moreover, it is one of the storage polysaccharides found in cereal seeds. It is a pentosan, its backbone is composed of beta-1,4-linked xylopyranosyl units that are to a various extent decorated by different side chains. The influence of these branches on endoxylanases, the main enzymes degrading the polysaccharide, is well understood. However, there is a paucity of knowledge on the influence of the branches on the action of so-called auxiliary xylanolytic enzymes. In particular, the influence of other substituents in the vicinity of the linkage to be cleaved is poorly recognized. It will be the topic of the Ph. D. thesis. More specifically, the effect of various combinations of acetic acid, (4-O-methyl-)alpha-D-glucuronic acid and alpha-L-arabinofuranose linked to the same or penultimate xylosyl residue will be studied. As the substrates, commercially available, home-made as well as chemically synthesized oligosaccharides will be used to differentiate various types of acetylxylan esterases, alpha-glucuronidases and beta-xylosidases. On the basis of amino acid sequences, all these enzymes are grouped to various carbohydrate esterase and glycoside hydrolase families but this classification is not related to the recognition or tolerance of the substrates that are decorated in a more complex manner. These complex substances are thought to be natural substrates for the above mentioned and so far underestimated enzymes that are, however, also important for economically feasible utilization of plant biomass.



Omezení k tématu

K přihlášení řešitele na téma je potřeba splnění jednoho z následujících omezení

Omezení na studijní program
Tabulka zobrazuje omezení na studijní program, obor, specializaci, který musí mít student zapsán, aby se mohl na dané téma přihlásit.

ProgramZaměřeníSpecializace
D-BICH biochémia-- nezadáno -- -- nezadáno --